Dans un futur indéterminé, la Terre est ravagée par des catastrophes et les humains émigrent en masse vers la planète Mars à bord d'immenses vaisseaux commerciaux. À bord de l'Aniara, les passagers vaquent nonchalamment à diverses occupations consuméristes en attendant la fin du voyage, qui doit durer trois semaines.

Mais un accident fait dévier le vaisseau de sa trajectoire, l'envoyant se perdre dans le cosmos. Dès lors, le microcosme de société formé par l'équipage et les passagers traverse diverses phases, entre cultes religieux néo-païens et désespoir existentiel.

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